關于勞動法和勞動仲裁

情況是這樣，今年3月我從原先的單位離職，離職之前的2月份我只上了8天班，原因是病假和事假，員工手冊上規(guī)定了請一天的病假要扣一天的工資，請一天事假要扣2天的工資，因為我的工資只有1000元左右，所以人事算了扣款情況后，到今天跟我說我2月的工資全扣了之后，公司還要扣700多塊錢，就是說我現(xiàn)在欠了他們700多塊錢。
問題是，我1月份是正常上班的，工資有800多塊錢（做業(yè)務，工資不穩(wěn)定），直到我3月離職到現(xiàn)在也沒發(fā)，一直就找借口拖來拖去的，現(xiàn)在找到了這個理由，我欠公司700，公司欠我800，來回就變成我先交公司700，他們在給我800。
想請問熟悉法律或者勞動糾紛的朋友，企業(yè)有權憑員工請假的理由扣款直到整月工資扣沒了還能再從當月扣嗎？（當月變?yōu)樨摴べY）
我要是申請勞動仲裁或者去法院勝算大嗎？

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